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邯鄲基因測序破解出生缺陷之謎

來源: 河北日報  
2013-03-25 08:38:54
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  邯鄲8種人類基因新發(fā)突變實現(xiàn)世界首報

  基因測序破解出生缺陷之謎

  人類有幾萬個基因,每個基因又有多種突變形式,說不定DNA鏈條上哪個“零件”不合格,就會導致人的身體發(fā)生病變。什么樣的基因突變會導致何種病變,這需要科研人員進行逐個探索。“我們與復旦大學出生缺陷研究中心合作,通過對邯鄲邢臺地區(qū)200多例耳聾患者的常見耳聾基因進行測序,在全球率先發(fā)現(xiàn)了8種人類基因新發(fā)突變,日前已在美國耳鼻喉科學報上發(fā)表。”3月7日,邯鄲市中心醫(yī)院院長要跟東表示,隨著基因檢測技術(shù)不斷發(fā)展,將可以鎖定部分由變異基因引發(fā)的疾病,并提前進行防治。

  目前,我國出生缺陷發(fā)生率約為4%—6%,每31.5秒就有一個出生缺陷的患兒出生。“但98%的基因尚屬未知領(lǐng)域。”要跟東認為,由于大量疾病仍無法確定基因突變源頭,基因資源已成為各國搶奪的熱點,破譯更多與出生缺陷疾病相關(guān)聯(lián)的變異基因密碼成為世界性課題。

  豐富人類基因突變數(shù)據(jù)庫,發(fā)現(xiàn)30%耳聾患者由4個常見突變基因所致

  “基因突變導致的變異可以從基因測序峰圖上明顯看到。”3月7日,邯鄲市中心醫(yī)院出生缺陷研究實驗室負責人、主任檢驗師李守霞拿出一張基因測序峰圖給筆者看,這張圖顯示的是一名耳聾兒童的一段基因序列。“簡單地說,基因突變就是基因發(fā)出了錯誤指令,導致蛋白質(zhì)不能正確生產(chǎn)所需的‘零件’,從而引起身體功能障礙。”順著李守霞手指的地方可以看到,與其他拋物線規(guī)律的起伏不同,一條紅色拋物線在一個位點同時出現(xiàn)了兩個波峰,這跟正常人基因序列有很大差異。“這就類似于蓋房子本來需要方磚,但是放了一塊圓的,這個地方就會產(chǎn)生安全隱患。”

  事實上,確定基因突變與疾病的關(guān)聯(lián),遠沒有這么簡單。“需要多方驗證才能最終確定。”李守霞說,這張峰圖測序出的基因是我國人群常見的致聾基因之一SLC26A4。“而峰圖所屬的孩子除耳聾之外沒有其他明顯病癥,由此可初步推斷是因為峰圖上顯示的基因突變引起。”

  李守霞介紹,經(jīng)過中耳CT檢查,顯示孩子患有前庭導水管擴大綜合征,正是SLC26A4基因突變導致常見病癥之一,“由此最終確診孩子耳聾原因是SLC26A4基因突變。”

  解密基因突變與相關(guān)疾病的關(guān)聯(lián),對于防治由基因突變造成的遺傳性疾病,具有至關(guān)重要的意義。要跟東說:“我們新發(fā)現(xiàn)的8種人類基因突變形式,意義也在于此。”

  “通過基因測序技術(shù)發(fā)現(xiàn)突變基因,進而進行提前干預,可使更多孩子避免先天殘疾的發(fā)生。”邯鄲市中心醫(yī)院檢驗科主管檢驗師陳丁莉介紹說,耳聾位居我國各類殘疾之首,其中大約60%的聽力障礙由遺傳引起,防治形勢嚴峻。“目前研究發(fā)現(xiàn)的70多個遺傳基因與耳聾存在關(guān)聯(lián),只是找到了很小一部分,大量耳聾患者致病源頭至今還沒有找到。”“通過對邯鄲邢臺地區(qū)200多例耳聾患者進行基因測序,我們發(fā)現(xiàn)其中30%的耳聾患者是由我國4個常見突變基因所致。”李守霞介紹說,這意味著通過基因測序技術(shù)進行干預,至少可使其中的60個孩子避免聽力殘疾發(fā)生。“這僅僅是對4個常見基因的測定,隨著更多基因突變形式被破解,這個比例還會不斷提高。”

  基因測序儀可更精準檢出突變基因,科學預防能降低患病幾率

  控制著我們生老病死、對人類如此重要的基因突變,真的可以準確地檢測出來嗎?“以前使用生物芯片進行基因檢測,只能針對設置好的幾種基因突變類型,如果有新發(fā)基因突變確實不能識別。”出生缺陷研究實驗室研究人員介紹說,如今開始使用基因測序儀進行診斷,可以快速檢測出所有已知和未知的基因突變,再逐個進行排除,可以確保不會有“漏網(wǎng)”。

  目前,邯鄲市中心醫(yī)院正對一臺一代基因測序儀進行安裝調(diào)試,近期將會應用于臨床。“檢測結(jié)果將更加精準。”李守霞說,這或為全省首次使用該設備進行基因突變臨床診斷。

  如此精準的檢測結(jié)果是如何測出的呢?“只要抽取2毫升血,就能進行一次耳聾基因檢測,這種篩查不僅能發(fā)現(xiàn)先天性耳聾,還能發(fā)現(xiàn)遲發(fā)性耳聾和藥物性耳聾高危個體。”

  陳丁莉解釋,首先要將染色體中與耳聾相關(guān)聯(lián)的一小段遺傳物質(zhì)“剪”下來。然后把這個小片段擴大成千上萬倍,找出其中的突變基因。之后用基因測序儀繪制出這個基因每一個位點的峰圖,與基因原始序列這把“標尺”進行比對。“基因檢測只是基礎(chǔ),最重要的是怎樣根據(jù)基因突變特點,選取最合適的防治方法,以此將基因突變對健康的影響降至最低。”李守霞說。

  以耳聾突變基因為例,研究人員解釋,有些基因突變點是藥物性耳聾的致病突變位點,攜帶者使用氨基糖甙類藥物就會引起不可逆的耳聾,“這些人群需要注意,只要一生中不服用氨基糖甙類藥物,就會避免耳聾風險。”

  此外,“還有一些基因可以引起隱性遺傳性耳聾,這種基因突變的特點是當個體的一對等位基因都發(fā)生突變,才會出現(xiàn)耳聾。”李守霞表示,由此產(chǎn)生的后果是,兩個攜帶同一突變基因的人結(jié)婚,就有可能生出耳聾孩子。“對于這種情況,患者只要不與攜帶同樣基因型者結(jié)婚,便可減少新生聾兒的發(fā)生。”“由于基因突變情況復雜,對于為何會導致基因突變,目前世界范圍內(nèi)仍然沒有得出定論。”對此,要跟東建議,“如果本身為聽力障礙人群,或是家族有聽力障礙人群,在面臨婚育抉擇時,可做一個常見耳聾基因突變的檢查,以減小后代中出現(xiàn)遺傳性耳聾的可能性。”

  建立全省第一個出生缺陷樣本庫,目前存放著4000多例樣本

  “了解到基因突變的發(fā)病機理,可以在疾病預防和診斷兩方面起到重要作用。”要跟東所希望的遠不止解決遺傳性耳聾的問題:耳聾基因篩查成果是一個良好的開端,“再看長遠一點,比方說能不能通過基因檢測技術(shù),使預防病因更為復雜的先心病等出生缺陷疾病變?yōu)楝F(xiàn)實。”

  目前,出生缺陷疾病防治工作已經(jīng)在科研方面有所開展。在邯鄲市中心醫(yī)院采訪過程中,筆者看到最多的是大大小小的冰箱。對此,李守霞頗為自豪地說:“這里面存放著4000多例與出生缺陷有關(guān)的樣本,這是全省首個也是最大的出生缺陷樣本庫。”她告訴筆者,這些珍貴的樣本是歷時幾年一例例搜集而來,多家實力雄厚的大醫(yī)院和科研機構(gòu)都主動要求合作開展相關(guān)研究。

  據(jù)統(tǒng)計,我省每年出生先天愚型和先天性心臟病缺陷兒8100多名,給患者家庭增加經(jīng)濟負擔6.8億元,給社會增加經(jīng)濟負擔11.8億元,出生缺陷已成為嚴重的公共衛(wèi)生和社會問題。

  “出生缺陷是指嬰兒出生前就已發(fā)生的身體結(jié)構(gòu)、功能或代謝異常,大多是基因突變導致。”要跟東表示,有關(guān)基因檢測預防出生缺陷項目的研究,可降低出生缺陷兒的死亡率和致殘率,提高其生活質(zhì)量。這對減輕社會和家庭負擔,提高人口素質(zhì)具有極其深遠的影響。

  陳丁莉提醒,如夫妻任意一方有出生缺陷家族史,或者雙方正常但曾經(jīng)生育過有缺陷的孩子,這類人群屬于出生缺陷高危人群,在準備生育前最好到相關(guān)醫(yī)療機構(gòu)進行基因檢測,預防出生缺陷新生兒的產(chǎn)生。

關(guān)鍵詞:邯鄲,基因測序,缺陷責任編輯:燕銳