針對韓亞航空客機失事原因，韓美兩國仍在不排除任何可能的前提下進行調查，但美方已將調查重點轉向客機駕駛員，從而引發各種猜測以及韓媒的不滿。

　　據韓聯社7月9日報道，美國國家運輸安全委員會(NTSB)主席赫斯曼在美國時間8日舉行新聞發布會表示，黑匣子分析結果顯示，客機墜毀16秒前，飛行速度僅為時速122公里，遠低于時速157公里的目標速度。事發前，客機馬力僅為正常水平的50%，由于駕駛員再次加大馬力，墜毀前飛行速度達到了時速136公里。也就是說，失事客機接近跑道時的速度明顯低于正常速度。

　　赫斯曼表示，駕駛員是否使用過自動降落系統和自動導航系統，是否進行了手動降落，也是本次調查的重要內容。據悉，目前正在對失事客機駕駛員展開重點調查，調查范圍涉及到他們的駕駛方法、訓練過程及駕駛經驗等。赫斯曼還說，由于客機失事的原因錯綜復雜，NTSB正在考慮所有可能性，現在認定是駕駛員失誤導致事故發生還為時過早。針對有媒體報道稱一名遇難中國女學生可能被救援車輛輾軋，赫斯曼表示，目前正在對機場的監視器視頻進行分析，需要查清楚死者的死亡時間，兩名遇難者的死因以圣馬特奧法醫辦公室的檢驗報告為依據，檢驗報告已推遲公布。

　　韓聯社下屬的電視頻道9日報道說，美國國家運輸安全委員會一般出言謹慎，但這次卻詳細公布了韓亞客機失事前的速度?？紤]到調查飛機失事一般短則需要6個月，長則一兩年，美方做法非常罕見。

　　韓國國土交通部9日表示，美國NTSB公布的內容只是雷達資料和黑匣子資料。不能草率認定是飛行員的過失，應根據客觀調查判斷事故的原因。為分析黑匣子，韓國9日上午向舊金山增派兩名調查人員。

　　韓國《國民日報》社論批評美國NTSB輕率地向媒體公布調查情況，并批評美媒在未得出結論之前就將事故原因的分析重點放在駕駛員身上，并要求美方調查機場方面有無過失。韓國《文化日報》9日稱，有人認為，著陸瞬間前后，機場的地面控制人員正在換班，未能縝密應對飛機降落。

　　韓國《朝鮮日報》9日披露，發生客機失事的舊金山機場的結構可能對事故也有一定影響。舊金山機場因地形復雜，被美國聯邦航空管理局分類為“特別機場”。機場設在海邊，跑道向海邊延伸，這樣的地理位置形成海風和陸地風交替，導致風力較強，經常突然起風或風速變化頻繁。韓國前航空官員稱：“這對駕駛員來說，心理壓力相當大。”

　　另據日本時事通訊社報道，東京消防廳9日稱，從羽田機場起飛前往美國舊金山的日航一架波音777客機9日凌晨因機體出現異常返航。